實驗室超純水系統的工作原理是自來水經過精密濾芯和活性炭濾芯進行預處理，過濾泥沙等顆粒物和吸附異味等，讓自來水變得更加干凈，然后再通過反滲透裝置進行水質純化脫鹽，純化水進入儲水箱儲存起來，其水質可以達到國家三級水標準，同時反滲透裝置產水的廢水排掉。
超純水機的反滲透原理是在原水一方施加比自然滲透壓力更大的壓力，使水分子由濃度高的一方逆滲透到濃度低的一方。由于反滲透膜的孔徑遠遠小于病毒和細菌的幾百倍乃至上千倍以上，故各種病毒，細菌，重金屬，固體可溶物，污染有機物，鈣鎂離子等根本無法通過反滲透膜，從而達到水質凈化的目的。
實驗室超純水系統采用多介質過濾器、活性炭過濾器及保安過濾器作為前級處理，有效除去原水中的懸浮物、泥砂、微粒、有機硅膠體、有機物、異味、余氯等雜質，使經過處理后的原水符合反滲透的進水要求，然后進入程控反滲透裝置去除水中的溶解性鹽類物質、細菌、熱源等，然后使用離子交換混床進行深度脫鹽，使產水電阻率達到15～18.2MΩ.cm，后處理采用紫外線殺菌器和精密過濾器隔絕細菌的二次污染，產水可達到國家電子級水的技術指標GB11446.1-1997。
1、實驗室超純水系統工作壓力高，不漏水：由于模塊采用了橡膠O型圈多層密封，保證了模塊耐壓高、不漏水。
2、無化學物質使用：由于濃水中填充了樹脂，降低了膜電阻，因此系統中不需要濃水循環及注鹽在淡水室填充分層排列樹脂，更有利于弱電解質的祛除。
3、系統簡單，配管簡單，僅需3支配管（進水管，產品水管和濃水管），無循環泵及注鹽系統，不需要PLC程序控制器，系統建造成本和維護費用低。
4、濃水回收，濃水水質（20-100μS/cm）優于原水水質，可回收至RO前繼續使用。
5、實驗室超純水系統不注鹽，因此不產生氯氣破壞模塊內部結構及污染周圍環境，獨立的模塊電源控制，單一模塊需維修，不影響其他模塊正常工作。
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